STEB: Pokročilý
Pokročilý
V tejto kategórii súťažíš, ak si sa do STEB-u zapojil/a už aj vlani, alebo ak študuješ v poslednom ročníku strednej školy a do STEB-u sa zapájaš prvý krát.
Séria 1: Výskum genomiky prirodzených populácií
Gény sú pre evolučných biológov mimoriadne dôležitým nástrojom: umožňujú nám pochopiť, ako sú si druhy podobné alebo ako sa navzájom líšia. Pomáhajú tiež odhaliť vzájomné vzťahy medzi druhmi, ktoré nemusia byť zrejmé z vonkajších znakov. V prvej sérii sa spolu s Dášou, mladou vedkyňou a autorkou tohto článku, zúčastníme na výskumnom projekte, ktorý realizovala s cieľom lepšie pochopiť nezvyčajnú populáciu drobných spevavcov na Urale.
Riešenia zadaní 1. série odovzdajte najneskôr do polnoci 30. októbra.
Sekvencie na projekt
DNA na PCR a sekvenovanie
ATGTTCATTAACCGATGACTATTCTCTACCAATCACAAAGACATTGGTACCCTGTATTTACTATTTGGCGCCTGGGCAGGAATAGTAGGTACCGGTCTAAGTTTGTTGATTCGTGCTGAATTAGGTCAACCTGGCACACTTATCGGAGACGACCAGCTTTATAATGTTCTAGTGACAGCTCATGCCTTCGTAATAATTTTCTTTATAGTTATACCTATTATAATTGGAGGTTTTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATAATTGGAGCTCCTGACATAGCATCCCGTCTAAACAACATAAGCTTCTGACTACTCCCCCCTTCCTTTCTACTACTAATAGCATCCTCTTCAATGAGGCCGGCGCAGGTACAGGCTGAACTGTTTACCCTCCTCTAGCCGGAAATCTGGCACAAATTTGCAGGAGCCTCAGTAGACCTTACCATTTTCTCTCTACATTTAGCCGGTGTATCTTCAATCCTTGGAGCTATTAACTTCATCACAACTATTATCAATATAAAACCACCCGCTATAACTCAATACCAAACACCCCTCTTCGTCTGATC
Vzorka 1-5, Inzulín
Sample 1: AGTCCTCTGGGACCAGCTGTGTTCCCAGGCCCCCGGCAACGAGGTCCTCACCCCCCGCCATGGCCCTGTGGACGCGCCTCCTGCCCCTGCTGGCCCTGCTGGCCCTCTGGGCGCCCGAAAAGGCCCAGGCCTTCGTGAACCAGCACCTGTGCGGCTCCCACCTGGTGGACTGTACCTGGTGTGCGGGGAGCGCGGCTTCTTCTACACGCCCAAGGCCCGTCGGGAGGCGGAGAACCCTCAGGCAGGTGCCGTGGAGCTGGGCGGAGGCCTGGGCGGCCTGCAGGCCCTGGCGCTGGAGGGGCACAACACACGCAGAAGCGTGGCATCGTGGAGCAGTGCTGCACCAGCATCTGTTCCCTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAACTAGGCCGCCCCTGAGGGCGCCTGCTGCTCCCCGCACCCCCCCCCCCAATAAA
Sample 2:
AGCCCCCCGCCCTCAGGACCGGCTGCATTCGAGGCTGCCAGCAAGCAGGTCCTCGCAGCCCCGCCATGGCCCTGTGGACACGCCACCGGCTGCATTCGAGGCTGCCAGCAAGCAGCCCCCGCTGTCGCCAGGTCCTCGCAGCCCCGCCATGGCCCTGTGGACACGCCTCTGTGCCAGCGTCTGCTCGCTCTACCAGCTGGAGAACTACTGTAACTAGGCCTGCCCCCGACACCAATAAACCCCTTGACGAGCCGGTGGAGGCGCTGTACCTGGTGTGCGGAGAGCGCGGCTTCTTCTACACGCCCAAGGCCCGCCGGGAGGTGGAGGGCCCCCAGTGCTGTGCCAGCGTCTGCTCGCTCTACCAGCTGGAGAACTACTGTAACTAGGCCTGCCCCCGACACCAATAAACCCCTTGACGAGCCCTGCAAAAAAAAAAA
Sample 3:
CGGGACGAGCTGCACTCGAGGCCGTCAGCAAGCAGGTCCTCGTGCCCCCACCATGGTCCTGTGGATGCGCCTGGTGCCCCTGCTGGCCCTGCTGGCCCTCTGGGCGCCCGCCCCTGCCCGGGCCTTCGTCAACCAGCACCTGTGCGGCTCCCACCTGGTGGAGGCACTGTACCTGGTGTGCGGGGAGCGTGGCTTCTTCTACACGCCCAAGGCCCGCCGGGAGGTGGAGAGCCCGCAGGTGGGGGCCGTGGAGCTGGGTGGAGGCCCCGGTGCAGGCGGCCTGCAGCCCCCGGCCCTGGAGGGGCCCCCGCAGAAGCGCGGCATCGTGGAGCAGTGCTGCACCAGCATTTGCTCCCTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAACTAGGGCCCGGC
Sample 4:
error_02_sequencing_ unsuccessful*
Sample 5:
CAGCCCTCGGGACGAGCTCACTCGAGGCGTCAGCAAGCAGGTCCTCGTGATGGTCCTGTGGCTGCGCCTTGGGCCCCTGCTGGCCTGCTGGCCCTGCTGGCCCTCTGGGCGCCCGCCCCTGCCCGGGCCTTCGTCAACCAGCACCTGTGCGGCTCCCACCTGGTGGAGGCGCTGTACCTGGTGTGGTGGCTTCTTCTACACGCCCAAGGCCCGCCGGGAGGTGGAGGGCCCGCAGGGCCCGCAGGTGGGGGCCGTGGAGCTGGGTGGAGGCCCCGGTGCCGGCGGCCTGCAGCCCCCGGCCCTGGAGGGGCCCCCGCAGAAGCGCGGCATCGTGGAACAGTGCTGCACCAGCATTTGCTCCCTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAACTAGGGCCCGGCGGGCGCCCCCT
*error_02_sequencing_ unsuccessful je chybový výpis sekvenčného zariadenia. Znamená to, že prístroj nebol schopný vzorku sekvenovať, pravdepodobne z dôvodu malého množstva alebo nízkej kvality izolovanej DNA. Žiaľ, znamená to, že nemáte žiadne informácie o géne inzulínu pre vzorku 4.
Vzorka 1-5 Cytochróm C
Sample 1:
AGAGTACGCGGGGAGACCCAGAAAGCGGGACGTCCGGCCTGCGAGTGGTGGCTTGTCTGTTGAGCTCGGCGAAAGAACGATTTTAAAATGGGTGATGTTGAGAAGGGCAAGAAGATTTTTGTTCAGAAGTGTGCCCAGTGCCACACTGTAGAAAAGGGAGGCAAACACAAGACTGGTCCAAACCTCCATGGTCTCTTTGGGCGGAAGACAGGTCAGGCTCCTGGATTCTCTTACACAGATGCCAACAAGAACAAAGGCATCACCTGGGGAGAGGAGACACTGATGGAGTACCTGGAGAATCCCAAGAAGTACATCCCTGGAACAAAAATGATCTTCGCTGGCATTAAGAAGAAGGGAGAAAGGGAAGACTTGATAGCTTATCTGAAAAAAGCTACTAATGAGTAAAAGTTGGCCACCGCCTTATTTATTACAAGACCGACGTGTCTCATGACTTTTATATGTGTACCATATTTAAATTGATCTCATACTCTAGAATTCAGATCATGTATGGCTGATGGAATGTTTCTGTTGGATGGTCCTGATTTAAATAAGATTGGTTGGTGGCTAAATGAATATGGTCAGCTGTTTGAATTTTAATATTAATTCTAGTTCAACAAGTACTATCACTGTCTTTCCCTTCTACAGAGATGGTTAAACTTGAATGCGGAGTGTTAAACTTTTCAGGAAAATGGTGAATACCTTCTCAGAACCTATAGGAGATTGGTTTTATATTTAGATTTCTGTAACTGGTTATATTAATATATTTAAATACTGAGAAGATCCCTTCACTGTCTCATAGAACAGAGCAAGATTCACCTGTGTTTCAAGTTGTGTTCACTAGCCTGTTAAGGCATGAGCCAATAGTAAACTGACAGTGTCCCCTTTATCTTTTTGGTCTTAACTATGCCAATTTCATTAAAATTACCTGTATCGAAAATACTGCCTTTTACTTATTGAAAGGTATTTTAGTGAGGTTTATGTACAGCATCAAGTAAAGAGTATTTAGCATTTCTCACATTTTATAGATGATCTTTAAGATCAGAGGCTTTTAAAATTCAGTGTGACGAGATATGTTAGCAGACTTTGCAGGTGAATTCTTACAAGGTCAGGCTGTTAGAATGCAGGATTGTCTTTTAAATAGGTAGTCAGAAACACAACTGTAGAACTCCCGGATGTGTGTGATTGATAATGGTGCTTTTGCCAACTCATGGAAGGCTTAAAGTAGGGGAGCTGTACCATCAGCACAGATTTGTAAATTATCTGGTCATAAAGCTTAAGAATTAAAAACAAAATCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
Sample 2:
GGAGCCAGTTTGGTTGCACCAACACCGGTACTTAGGCACGTACCGGCGTGTCCTTGGGCTTAGAAAGCGGGACGTTCGGCTTGTTAGCGGGAACTTCTCGGTCGCGCACAGAGAAAGAACGATTTAAAAATGGGTGATGTTGAGAAGGGCAAGAAGATTTTTGTTCAGAAGTGTGCCCAGTGCCATACTGTGGAAAAGGGAGGCAAGCACAAGACTGGGCCAAACCTCCATGGTCTGTTTGGACGAAAGACAGGTCAGGCTCCTGGATTCTCTTACACAGATGCCAATAAGAACAAAGGTATCACCTGGGGAGAGGAGACGCTGATGGAGTACTTGGAGAATCCCAAGAAGTACATCCCTGGAACAAAGATGATCTTTGCTGGCATTAAGAAGAAGGGAGAGAGGGAAGACTTGATAGCTTATCTCAAAAAAGCTACCAATGAGTAATAGTTGGCCACTGCCTTATTTATTATGAATCAGAAGTGTCTCATGACTTTTTATGTGTACCATATTTAAATTGACTCATATACTAGAATTCAGATCATGAACGGCTGATGGAATAATTCTTTTGGACAGTCCTGATTTAAATAAGATTGGTTTGTGGTTAAACGAATATGGTCAGCTTTTTTAATTTTGATAGTAATTCCGGTTCAACAAGTACTATCATTTTTCCCATTCTAAAGAGATGATTGAACTTGAATAAGGAATATTAAACTTTTTAGGGAGATGGTACATTGCTTCTCAAAACCTATAAGAGATTGGTTTTATATTTAGATTTCTATAACTGGTTATATTAATATATTTAAATACTGAAAAGGTGCCTTCACTGTCTCATAAACAGAGGAGGAGTCACATGTGTTTCAAGTTGTGTTCATTAGCCTGTTAAGGCAAGGATTGAAAATACACTGACAAAGTCCACTTTATCTTTTTGGTTTTATAAACTATGCCAATTTAATTAAAATTCTCTATCTAATAAAAAAAAAAAAAAAA
Sample 3:
GGAGCCAGTTTGGTTGCATTTTCACCCGTACATAGGCGCGGACCGGCGTGTCCTTGGGATTAGAGAGCTGGACGTTTGGCTTGCGAGCGGGGACGGCTTAGTCGTACACGGAGAAAGAACGATTTCGTACACGGAGAAAGAACGATTTAAAAATGTGTGATGTTGAGAAGGGCAAGAAGATTTTTGTTCAGAAGTGTGCCCAGTGCCATACTGTGGAAAAGGGAGGCAAGCACAAGACTGGGCCAAATCTCCATGGTCTGTTTGGGCGAAAGACAGGTCAGGCTGTCGGATTCTCTTACACAGATGCCAACAAGAACAAAGGCATCACCTGGGGTTGGAGAATCCCAAGAAGTACATCCCTGGAACAAAAATGATCTTCGCTGGCATTAAGAAGAAGTCAGAAAGGGCAGACTTGATAGTCAGAAAGGGCAGACTTGATAGCTTATCTCAAAAAAGCTACTAATGAGTAATAGTTGGCCACTGCCTTATTTATTATGAAACAGCTGTCTCATGACTTTTTATGTGTACCGTCAGTGTTTTCCCCTTCTAAAGAGATGATTAAACTTGAATAAGGAATGGTGGCTAAATGAATATGGTCAGCTTTTTGAATTTTGATAGTAATTCTGGTTCAGCAAGTACTGTCAGTGTTTTCCCCTTCTAAAGAGATGATTAAACTTGAATAAGGAATGTTAAACTTTTCAGGGATATGGTGAATGCCTTCTCAAACCCTATAGGAGATTGGTTTTATATCTTTATCTTTTTGGTCTTAAATATGCCAATTTAATTAAAATTCTCCATCTAAAATATTGCGTTTTACTTAATGAAGGGCATTTTAGTGTGGTTTATGTATAGCATCAGATAAAGAATATTTAGTACTTCTCACATTTTAGAGATGATCTTTAAGATCAGATGTTTTTAAAATTCAGCGTTTTACTTAATGAAGGGCATTTTAGTGTGGTTTATGTATAGCATCAGATAAAGAATATTTAGTACTCACATTTTAAAGATGATCTTTAAAGCTCTATCATTAGCACAGATTTGTAAATTATCTGATCATAAGGCTTGAGAATTAAAAACAAAGTCACAGATCAATTATCTGATCATAAGGCTTGAGAATTAAAAACAAAGTCACA
Sample 4:
AGTTCGGTTGCACCAACACCGGTACTTAGGTGCGGACCGGCGTGCCCTTGGATTTAGAGAGCGGGACGTCCGGCTTGCGAGCGGGCACCTTCGTTTCGCGCGCGACGAAAGAGCGGTGAGCGCGCGGCGCGGAGGCCGAAGCGGGAGGGAAGCCGAGCCACGGATTTAAAAATGGGTGATGTTGAGAAGGGCAAGAAGATTTTTGTTCAGAAGTGTGCCCAGTGCCATACCGTGGAAAAGGGAGGCAAGCACAAGACTGGGCCAAATCTCCATGGTTTATTTGGCCGAAAGACAGGTCAGGCCCCTGGATTTTCTTACACGGATGCCAACAAGAACAAAGGCATCACCTGGGGAGAGGAGACACTGATGGAGTATTTGGAGAATCCCAAGAAGTACATCCCTGGAACAAAAATGATCTTCGCTGGCATTAAGAAGACAGGGGAAAGAGCAGACTTGATAGCTTATCTCAAAAAAGCTACTAAGGAGTAATAATTGGCCATTGCCTTATTTATTGCAAAACAAAAATGTGTCATGACTTTTTTTTATGTGTACCGTATTTAAATTGATCTCATACACCAGAATTTGGATCATGAATGGCTGATAGAATATTTCTTTTGGACAGTCCTGATTTAAATAAGATTGGCTTGTGGTTAAGTGAGTATGATCAGCTTTTGAACTCTGATAGTAATTCTGGTTCAGCAAGTGCTATCACTGTTTTCCCCTTCTAAAAATATGATTGGAATTGATTAGTAATGTTCAGCTTTTGACAGAGATGGTAAATGCTATCTCTAAACTTAGATTGGTTTTATATTTAGATACATATAACTTGTTATATTAATATATTTAAATACTGAGGAAACCCCTTCACTGTCTCAGAACCATCAAGACTCAACTGTGTTTCAAGTTGTGTTCGTTAGCCTGTTAAAGGCAAGGGTTGAAGATAAGCTGGCAGTGTCCATTTTATCATTTTGGTCTTAACTATGCCAATTTAATTAAATTCCCTGCATCTAAAATGTTGCCTTTTGCTTAATGAAAGGCATTTTAGTGTGTTTATGTATAATATTAAAGAATATTTAACACTTCTCACATTTTATAGATGATCTGTAAGGTCAGATGCTTTTAAAATTCAGTGTGACGAAATACAGCGGCAGACTTGGCTGGTGAATTCTCTACTAAGTCAGACTAAATTATAATTTAGGATTGTCTTCTAAACAGCTATTCAAAGACACAGCTGTGGAAATACCATATGTGTATGATTGGTAATGGTGCTTTTGCCAACTCGTTAGAAGGGTTAAAATAGAGGAGATATATCATCAGCACAAATTTGTAAATTATGTGATAAGGCTTAAGATGATTAAAAACAAAATCACAGATCATGA
Sample 5:
GGCATTTATCACAGTTTCTCTCAGATATAAACTGTCTGAGGGTAAGGACTTCGTCTTGCTCATCACTGTATTTCCAGCACTGACAAGAGTGCTTATACAGGTAGATACACAAAAAAGATTGTTAAGTGGATGAATATATTCACTGAGTAATTTCCTCCTTTAGACTGTAAGCTTCAAGAGGGTAGGACATTTTATTTTGTTCACTAGAGTATTTCTCAGTGCCTACAGAACCTGGGATATTATAGGTGCTCAATAAACATTTGGTGACTGATGAATTGAATGAATGAGTGAGAAAAGTAGTTTTAAATAAGGATGGAGGCCAGAGTAAGGTCATTTAATAAAGAATTTTATTTGCAATGCTGAGAAGCTTAAATTTTAGACTCCTTGGGGAATTTTAAGCAGGAGAGTGACATATGCAGGCTTACCTTCAATCTAGAAGGATCCCTTCAGCAATTATGTGGAGGATAGTTGGAACATTATAAAGCTATTGCTGTAATATAGGAAAGAGATCAAGCCCTGATACAAGGTAGTTGGAATAGAGAAGACAAATTCAAGGAAATTTAGAAATGCTGTATGTTAGATTAAGATAATGGCTGGATTAAGGTAGGGGAAGAAGGGGAAGAATCTAGCATCACTCCCTGAGTTTCTTATTTGGGAGACCACCTAGAGTAGGCACTCTAAGAAGAAGGGCAGGTTTGGGAGTGAATGAATTTAATTGAGACGTTAATTTTTTTTTAACATGGGAAATCTGGATAATTTTATTGATTTTTGGTAGATTTAGCTGGATTATGGATCTTCTTTTTTTTCTCCCTCACACATACTTAATCCTTTATGTATAAATATACAAAACCTACCACCCCTTGTTTTTTAAGAAACTGATTTGAGTTAAGCAGTTCTTTTACTAGGGACATGTTCCATTTGAGTTTCCTGTGGGATATCCAGGTGGAGATGTACATAGGTAATATGGAGCTCAGTTGAGAAGGTCTGTTTCTGTACTATTCCTTATAATTTCAGTTAAAACAACCTGATGGGCACCAACACCCATACATAGGCGCGAACTGGCGTGTCCTTGGGCTTAGAGAGCGGGACGTTCAGCTTGCGAGAGGGAACCTCTTAGTTGGGTACGGAGAAAGAACGATTTAAAAATGGGTAATGTTGAGAAGGGCAAGAAGATTTTTGTTCAGAAGTGTGCCCAGTGCCATACTGTGGAAAAGGGAGGCAAGCACAAGACTGGGCCAAATCTCCATGGTCTGTTGGGGCGAAAGACAGGCCAGCCTGTCGGATTCTCTTATACTGATGCCAACAAGAACAAAGGCATCACCGGGGGAGAGGAGGCGCTGATGGAGTGTTTGGAGAATCCCAAGAAGTACATCCCTGGAACAAAAATGATCTTCGCTGGCATTAAGAAGAAGGGAGATAGGGCAGACTTGATAGCTTATCTCAAAAAAGCTAATGCGTAATCGTTGGCCACTGCCTTATTTATTATGAAACAAATGTCTCATGACTTTTTATATGTACCATATTTAAATTGATCTCATACACTAGAATTCAGATCATGAATGGCTGATGTAATATTTTTGTCCTGATTTAAATAACGTTGGCTTGTGGCTAAACAAATATGGTCAGCTTTTTGAATTTTGATAGTAATTGCGGTTCAACAAGTACTCTCACTGCTTTCCCTTTCTAAAGAGATGATTAAACTTGAATAAGGAATGTTAAACTTTTCAGGGATATGGTGAAGCCTTCTCAAACCCTATAGGAGATTGGTTTTATATTTAGATTTCTATAACTGATTATATTAATATATTTAAATATTGAGAAGCTCCCTTCACTGTCTCATAGAACAGCAAGAGTCACCTGTATTTCAAGCTGTGTTCATTTGCCTGTTAAAGCAAGGGCTGAAGGTACGATAACAATGTCCACTTTATCTTTTTGGTCTTAAC
Séria 2: Tajný svet pohlavného života rastlín
Ako si rastliny vyberajú partnera? Na rozdiel od živočíchov sa predsa nemôžu len tak postaviť a rozhliadnuť po vhodnom jedincovi. U väčšiny rastlinných druhov má tá istá rastlina samčie i samičie pohlavné orgány. Niektoré rastliny si zabezpečujú “partnera” tak, že sa jednoducho opelia sami. No mnoho rastlinných druhov je cudzoopelivých - na opelenie potrebujú iného jedinca. Tieto rastliny rozširujú svoj peľ pomocou vetra, vody alebo „presvedčia“ nejaké zviera, aby ho prenieslo na iné rastliny. Musia však vyriešiť ďalší problém: aby sa vyhli samoopeleniu, musí rastlina vedieť rozlíšiť, či na nej pristál jej vlastný alebo cudzí peľ.
Riešenia zadaní 2. série odovzdajte najneskôr do polnoci 11. decembra.
Séria 3: Výhonky stromu života: ako vznikajú nové druhy
Mnohí z nás ostávajú stáť v úžase nad neskutočnou diverzitou foriem života na Zemi. Vedci odhadujú, že počet druhov na planéte môže byť kdesi medzi niekoľkými miliónmi a ohromným biliónom (veľké rozpätie je spôsobené ťažkosťami pri počítaní bakteriálnych druhov). Čo však druhy vlastne sú a ako vznikajú?
Riešenia zadaní 3. série odovzdajte najneskôr do polnoci 29. januára.
Séria 4: Vzrušujúci svet génov a ich pôvod I
Genómy rajčiny a mačky divej majú mnoho spoločného, ale nie sú, prirodzene, rovnaké. Hoci zdieľajú časť svojich génov, niektoré gény existujú len v jednom z týchto druhov, ďalšie zas len v druhom. Ako sa to stalo? Čo sú vlastne gény a ako vznikajú?
Majú všetky gény spoločný spoločný pôvod? Môže gén opustiť svoje miesto a pobrať sa preč? Ako spolu súvisia nové gény a nové znaky organizmov?
Sekvencie potrebné na projekt
Alpha 1:
ATGGTGCTGTCTCCTGCCGACAAGACCAACGTCAAGGCCGCCTGGGGCAAGGTTGGCGCGCACGCTGGCGAGTATGGTGCGGAGGCCCTGGAGAGGATGTTCCTGTCCTTCCCCACCACCAAGACCTACTTCCCGCACTTCGACCTGAGCCACGGCTCTGCCCAGGTTAAGGGCCACGGCAAGAAGGTGGCCGACGCGCTGACCAACGCCGTGGCGCACGTGGACGACATGCCCAACGCGCTGTCCGCCCTGAGCGACCTGCACGCGCACAAGCTTCGGGTGGACCCGGTCAACTTCAAGCTCCTAAGCCACTGCCTGCTGGTGACCCTGGCCGCCCACCTCCCCGCCGAGTTCACCCCTGCGGTGCACGCCTCCCTGGACAAGTTCCTGGCTTCTGTGAGCACCGTGCTGACCTCCAAATACCGTTAA
Alpha 2:
ATGGTGCTGTCTCCTGCCGACAAGACCAACGTCAAGGCCGCCTGGGGCAAGGTTGGCGCGCACGCTGGCGAGTATGGTGCGGAGGCCCTGGAGAGGATGTTCCTGTCCTTCCCCACCACCAAGACCTACTTCCCGCACTTCGACCTGAGCCACGGCTCTGCCCAGGTTAAGGGCCACGGCAAGAAGGTGGCCGACGCGCTGACCAACGCCGTGGCGCACGTGGACGACATGCCCAACGCGCTGTCCGCCCTGAGCGACCTGCACGCGCACAAGCTTCGGGTGGACCCGGTCAACTTCAAGCTCCTAAGCCACTGCCTGCTGGTGACCCTGGCCGCCCACCTCCCCGCCGAGTTCACCCCTGCGGTGCACGCCTCCCTGGACAAGTTCCTGGCTTCTGTGAGCACCGTGCTGACCTCCAAATACCGTTAA
Beta:
ATGGTGCATCTGACTCCTGAGGAGAAGTCTGCCGTTACTGCCCTGTGGGGCAAGGTGAACGTGGATGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTGGTCTACCCTTGGACCCAGAGGTTCTTTGAGTCCTTTGGGGATCTGTCCACTCCTGATGCTGTTATGGGCAACCCTAAGGTGAAGGCTCATGGCAAGAAAGTGCTCGGTGCCTTTAGTGATGGCCTGGCTCACCTGGACAACCTCAAGGGCACCTTTGCCACACTGAGTGAGCTGCACTGTGACAAGCTGCACGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTCTGTGTGCTGGCCCATCACTTTGGCAAAGAATTCACCCCACCAGTGCAGGCTGCCTATCAGAAAGTGGTGGCTGGTGTGGCTAATGCCCTGGCCCACAAGTATCACTAA
Gamma A:
ATGGGTCATTTCACAGAGGAGGACAAGGCTACTATCACAAGCCTGTGGGGCAAGGTGAATGTGGAAGATGCTGGAGGAGAAACCCTGGGAAGGCTCCTGGTTGTCTACCCATGGACCCAGAGGTTCTTTGACAGCTTTGGCAACCTGTCCTCTGCCTCTGCCATCATGGGCAACCCCAAAGTCAAGGCACATGGCAAGAAGGTGCTGACTTCCTTGGGAGATGCCATAAAGCACCTGGATGATCTCAAGGGCACCTTTGCCCAGCTGAGTGAACTGCACTGTGACAAGCTGCATGTGGATCCTGAGAACTTCAAGCTCCTGGGAAATGTGCTGGTGACCGTTTTGGCAATCCATTTCGGCAAAGAATTCACCCCTGAGGTGCAGGCTTCCTGGCAGAAGATGGTGACTGCAGTGGCCAGTGCCCTGTCCTCCAGATACCACTGA
Gamma G:
ATGGGTCATTTCACAGAGGAGGACAAGGCTACTATCACAAGCCTGTGGGGCAAGGTGAATGTGGAAGATGCTGGAGGAGAAACCCTGGGAAGGCTCCTGGTTGTCTACCCATGGACCCAGAGGTTCTTTGACAGCTTTGGCAACCTGTCCTCTGCCTCTGCCATCATGGGCAACCCCAAAGTCAAGGCACATGGCAAGAAGGTGCTGACTTCCTTGGGAGATGCCATAAAGCACCTGGATGATCTCAAGGGCACCTTTGCCCAGCTGAGTGAACTGCACTGTGACAAGCTGCATGTGGATCCTGAGAACTTCAAGCTCCTGGGAAATGTGCTGGTGACCGTTTTGGCAATCCATTTCGGCAAAGAATTCACCCCTGAGGTGCAGGCTTCCTGGCAGAAGATGGTGACTGGAGTGGCCAGTGCCCTGTCCTCCAGATACCACTGA
Delta:
ATGGTGCATCTGACTCCTGAGGAGAAGACTGCTGTCAATGCCCTGTGGGGCAAAGTGAACGTGGATGCAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGATTACTGGTGGTCTACCCTTGGACCCAGAGGTTCTTTGAGTCCTTTGGGGATCTGTCCTCTCCTGATGCTGTTATGGGCAACCCTAAGGTGAAGGCTCATGGCAAGAAGGTGCTAGGTGCCTTTAGTGATGGCCTGGCTCACCTGGACAACCTCAAGGGCACTTTTTCTCAGCTGAGTGAGCTGCACTGTGACAAGCTGCACGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCTTGGGCAATGTGCTGGTGTGTGTGCTGGCCCGCAACTTTGGCAAGGAATTCACCCCACAAATGCAGGCTGCCTATCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTGGCTAATGCCCTGGCTCACAAGTACCATTGA
Epsilon:
ATGGTGCATTTTACTGCTGAGGAGAAGGCTGCCGTCACTAGCCTGTGGAGCAAGATGAATGTGGAAGAGGCTGGAGGTGAAGCCTTGGGCAGACTCCTCGTTGTTTACCCCTGGACCCAGAGATTTTTTGACAGCTTTGGAAACCTGTCGTCTCCCTCTGCCATCCTGGGCAACCCCAAGGTCAAGGCCCATGGCAAGAAGGTGCTGACTTCCTTTGGAGATGCTATTAAAAACATGGACAACCTCAAGCCCGCCTTTGCTAAGCTGAGTGAGCTGCACTGTGACAAGCTGCATGTGGATCCTGAGAACTTCAAGCTCCTGGGTAACGTGATGGTGATTATTCTGGCTACTCACTTTGGCAAGGAGTTCACCCCTGAAGTGCAGGCTGCCTGGCAGAAGCTGGTGTCTGCTGTCGCCATTGCCCTGGCCCATAAGTACCAC
Zeta:
ATGTCTCTGACCAAGACTGAGAGGACCATCATTGTGTCCATGTGGGCCAAGATCTCCACGCAGGCCGACACCATCGGCACCGAGACTCTGGAGAGGCTCTTCCTCAGCCACCCGCAGACCAAGACCTACTTCCCGCACTTCGACCTGCACCCGGGGTCCGCGCAGTTGCGCGCGCACGGCTCCAAGGTGGTGGCCGCCGTGGGCGACGCGGTGAAGAGCATCGACGACATCGGCGGCGCCCTGTCCAAGCTGAGCGAGCTGCACGCCTACATCCTGCGCGTGGACCCGGTCAACTTCAAGCTCCTGTCCCACTGCCTGCTGGTCACCCTGGCCGCGCGCTTCCCCGCCGACTTCACGGCCGAGGCCCACGCCGCCTGGGACAAGTTCCTATCGGTCGTATCCTCTGTCCTGACCGAGAAGTACCGCTGA
Séria 5: Vzrušujúci svet génov a ich pôvod II
V druhej sérii o génoch sa pozrieme na ďalšie zaujímavé otázky:
Môžu si živé organizmy navzájom gény požičiavať, alebo darovať? Môže byť gén ukradnutý? Môže zomrieť? Môže gén iba tak zrazu vzniknúť? Čo by sa stalo s bunkou, v ktorej by sa zrazu nový gén objavil? Akým spôsobom vlastne môžeme študovať pôvod génov a ich funkcie?
Sekvencie potrebné na projekt
Saccharomyces cerevisiae S288C chromosome IV - region of interest
Saccharomyces cerevisiae S288C chromosome IV - region of interest
AACAATAAACCTTTGCCTAATTTCATATAACATCCAGTATTCATTTTTTTTAGTTGACGCTAAGGCATTCGCTTGTGAAATTAAAGAGCAGATCAGGAATAGTATCAATAGTCTAAACCATCAAGTTGCACAGAAACCACTATATATATATGGAAATATCTCGAATATTGCTTGTATGAACGATAGCCAAAACTGCCTACGACAGAGGGAAGAAAATAGTCATCTGAATCCTGGAAATGACTTCGGCCACCACCAGGGTGCAGAATGTACGATAAATCATAACAACATGCCACACCGCAATGCATACACAGAATCTACGAATGACACGGAAGCAAAGTCCATAGTGATGTGCGACGATCCTAACGCATACCAAATTTCCTACACAAATAATGAGCCGGCGGGAGATGGAGCTATAGAAACCACGTCCATTCTACTATCGCAACCGCTGCCGCTGCGATCGAATGTGATGTCTGTCTTGGTAGGCATATTTGTTGCCGTGGGGGGCTTCTTGTTTGGGTATGACACTGGACTTATAAACAGTATCACGGATATGCCGTATGTTAAAACCTACATTGCTCCGAACCATTCATATTTCACCACTAGCCAAATAGCCATACTCGTATCATTCCTCTCCCTAGGAACATTTTTCGGTGCGTTAATCGCTCCCTATATTTCAGATTCATATGGTAGGAAGCCAACAATTATGTTTAGTACCGCTGTTATCTTTTCCATCGGAAACTCATTACAGGTGGCATCCGGTGGCTTGGTGCTATTAATCGTCGGAAGAGTGATCTCAGGTATCGGGATCGGGATAATCTCTGCTGTGGTTCCTCTTTATCAAGCTGAAGCTGCGCAGAAGAACCTTAGAGGTGCCATCATTTCCAGTTATCAGTGGGCTATCACTATTGGGTTACTCGTGTCCAGTGCAGTATCGCAAGGAACTCATTCCAAAAATGGCCCGTCTTCATATAGAATACCAATTGGTTTGCAGTACGTTTGGTCAAGTATTTTAGCTGTGGGCATGATATTCCTTCCAGAGAGTCCAAGATATTACGTCTTGAAGGATGAACTCAATAAAGCTGCAAAATCGTTATCCTTTTTAAGAGGCCTCCCGATCGAAGATCCAAGACTCTTAGAGGAGCTTGTTGAAATAAAAGCCACTTACGATTATGAAGCATCGTTCGGCCCGTCAACACTTTTAGATTGTTTCAAAACAAGTGAAAATAGACCCAAACAGATTTTACGAATATTTACTGGTATCGCCATACAAGCTTTTCAACAGGCATCTGGTATCAATTTTATATTCTACTATGGAGTTAATTTTTTCAACAACACAGGGGTGGACAACTCTTACTTGGTTTCTTTTATCAGCTATGCCGTCAACGTCGCCTTCAGTATACCGGGTATGTATTTAGTGGATCGAATTGGTAGAAGACCAGTCCTTCTTGCTGGAGGTGTCATAATGGCAATAGCAAATTTAGTCATTGCCATCGTTGGTGTTTCCGAGGGAAAAACTGTTGTTGCTAGTAAAATTATGATTGCTTTTATATGCCTTTTCATTGCTGCATTTTCGGCGACATGGGGTGGTGTCGTGTGGGTGGTATCTGCTGAACTGTACCCACTTGGTGTCAGATCGAAATGTACCGCCATATGCGCTGCCGCAAATTGGCTAGTTAATTTCACCTGTGCCCTGATTACACCTTACATTGTTGATGTCGGATCACACACTTCTTCAATGGGGCCCAAAATATTCTTCATTTGGGGCGGCTTAAATGTCGTGGCCGTTATCGTTGTTTATTTCGCTGTTTATGAAACGAGGGGATTGACTTTGGAAGAGATTGACGAGTTATTTAGAAAGGCCCCAAATAGCGTCATTTCTAGCAAATGGAACAAAAAAATAAGGAAAAGGTGCTTAGCCTTTCCCATTTCACAACAAATAGAGATGAAAACTAATATCAAGAACGCTGGAAAGTTGGACAACAACAACAGTCCAATTGTACAGGATGACAGCCACAACATAATCGATGTGGATGGATTCTTGGAGAACCAAATACAGTCCAATGATCATATGATTGCGGCGGATAAAGGAAGTGGCTCGTTAGTAAACATCATCGATACTGCCCCCCTAACATCTACAGAGTTTAAACCCGTGGAACATCCGCCAGTAAATTACGTCGACTTGGGGAATGGTTTGGGTCTGAATACATACAATAGAGGTCCTCCTTCTATCATTTCTGACTCTACTGATGAGTTCTATGAGGAAAATGACTCTTCTTATTACAATAACAACACTGAACGAAATGGAGCTAACAGCGTCAATACATATATGGCTCAACTAATCAATAGCTCATCTACTACAAGCAACGACACATCGTTCTCTCCATCACACAATAGCAATGCAAGAACGTCCTCTAATTGGACGAGTGACCTCGCTAGTAAGCACAGCCAATACACTTCCCCCCAATAAAAACCAATAGCATCTTACGATCGTTCGAGGTCTTATAAACCGTTTTATATAAATTATTCTTATACACGCACTCTTGAGTTTCTTTTAACATTCCAACATGATAGACATAGAAAAGAATTATAGATAACACATAACATTACTCACAAGTAGCCCATGAGTTTGATTTTTCCTCGTTAATTCGGTGTCAAGTGGAATACAAAATGGGTCAACTGATCATAACTATTACCCGGATAATCTACATCATGTGGTACGTTAACGATGTATGGTTTCCTAAATCACCGGGTTCCAGATGCGGGTTGTTGTTGTTCGATCTTGCACCTCCACGTACTCCTTTTGAATAGTACACATATACCCTTACAGGAGATCGGACGTGTGCGATTATTGTTACCTCGTCACCTGTTATCGGTTGAACTGTTTTAGCTCTTTCCATTCCCTTTGTTAATAGTAGTTTAATTCTTCGGAAACTTTCTACGCAGACTCAAGTTGCAATAGGCTAAAGATAAGGCAGACACTTTGTATGTAACGAGTTTCATTAGGAGGGATAGACGCACGACACTATCTGGTACTACGTGTTATATCATACCCAGAAGGAAGGACTCTCTCCACTGAACGGTGGGATGAGTTCCTAAAGGCGCCCCTTTATTTGATCAGGAAGCCGTATTGATTATCTAATAGGGCCTAGTTATCCTAATTGTGGGGAGTCGAGCAGTACGGCTCTGATGTTTTTCGAACGAAGATAAGGAGTTGACATACAAAGTCAACAGAAGTTCTTCTTGTTAGCGTCTCTGTGCTCAATATCTCTCTTTTTTTCTTTAAGTAGTAATTACTAACATCAGCCAACCAATAGAGATAAAAAAAAAAGGAATTAAGATTTCATAGAGAAAAGATGGGTCTATACGCTTCTAAGTTATTCAGCAATCTTTTTGGCAACAAAGAGATGCGTATACTTATGGTTGGTCTAGATGGTGCCGGTAAGACCACCGTTTTGTACAAGTTGAAGTTGGGCGAAGTTATCACTACCATTCCAACCATTGGTTTCAACGTTGAGACTGTCCAATATAAGAACATTTCCTTCACTGTCTGGGACGTCGGTGGACAAGACAGGATTAGATCTTTATGGAGACACTACTACAGAAACACCGAAGGTGTTATTTTTGTCATCGATTCCAACGATAGATCGCGTATTGGTGAAGCCAGAGAAGTCATGCAGAGAATGCTGAATGAAGATGAATTGAGAAATGCTGTCTGGTTAGTCTTCGCTAACAAACAAGATTTGCCAGAAGCCATGTCTGCTGCTGAAATCACCGAAAAATTAGGTTTACATTCTATTAGAAACCGTCCATGGTTTATCCAGTCTACTTGTGCAACCTCGGGTGAAGGTCTGTACGAAGGTCTGGAGTGGTTAAGCAACAACTTGAAGAATCAATCCTAATCTAAATCTGTATAGAACGTTTAGTCATGCGGACCTTGTGTGTTTTGTTTCTAGATTGTTTTATTTTTATGATTGTTGAAGATATAAACCACTGTATAGTTGTATAAGATAGGATAATGATGGTGCACTGAAAATAAACTTACTAGCTCTTTAATATTGCAACGGCTTGTAACGGGCGCCATGATGACATTCAGAATTATACCACTACTATATGAAAAAATGAAAAGAGGCCCTGCTTTGAACCCGTACATTTTATTCTATAATATTGCATCTGTGGTTTGCCTGACGGCAGCGAGTCCAACACAAAGTCTGGCATATGCTACGAATTTTCCACCATGGATTCAGCACCCAAACATTTGAATTTTTTTTCATGTCGATTGTGAAATTTTACTGAAGATGAGGGTAAATAGAGGCCTGCAATCGTCA
RNA-seq reads
>1
CCAGATGCGGGTTGTTGTTGTTCGATCTTGCACCT
>2
TTTTGAATAGTACACATATACCCTTACAGGAGATC
>3
TAAAAGCAATCATAATTTTACTAGCAACAACAGTTTTT
>4
ACTTCCCATTTCACAACAAATAGAGATGAAAACTA
>5
TATGGTTGGTCTAGATGGTGCCGGTAAGACCACCG
>6
TGGGACGTCGGTGGACAAGACAGGATTAGATCTTT
>7
TACCTCGTCACCTGTTATCGGTTGAACTGTT
>8
GGGTTCAAAGCAGGGCCTCTTTTCATTTTTTCATATA
>9
TCTGCTGCTGAAATCACCGAAAAATTAGGTTTACA
>10\\
TATAAGATAGGATAATGATGGTGCACTGAAAATAA
>11
CTTATACAACTATACAGTGGTTTATATCTTCAAC
>12
CGGCCCTGCTTTGAACCCGTACATTTTATTCTATA
>13
AATATTGCATCTGTGGTTTGCCTGACGGCAGCGAG
>14
GACTGGTCTTCTACCAATTCGATCCACTAAATACA
>15
GTGGTATAATTCTGAATGTCATCATGGCGCCCGTTACAA
>16
TTTCAAAACAAGTGAAAATAGACCCAAACAGATTT
>17
AGGATGAACTCAATAAAGCTGCAAAATCGTTATCC
>18
CGGTACATTTCGATCTGACACCAAGTGGGTACAG